Inkya No Ore Ga Sekigae De S-Kyuu Bishoujo Ni Kakomaretara Himitsu No Kankei Ga Hajimatta xoay quanh một nam sinh hướng nội, luôn thích sống khép kín và tránh xa rắc rối. Thế nhưng, cuộc sống bình lặng của cậu hoàn toàn bị đảo lộn sau một buổi đổi chỗ ngồi định mệnh, đưa cậu vào vị trí trung tâm giữa những mỹ nhân cấp S nổi tiếng nhất trường. Từ đây, hàng loạt những bí mật không ai biết và mối quan hệ ngầm đầy bất ngờ giữa cậu cùng các cô gái bắt đầu diễn ra.
